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創建生物質譜資料庫 廖志中教授登國際期刊

國立中山大學海洋研究中心海洋生物科技組廖志中教授與UCSD研究團隊合作,分析海洋生物次級代謝物之質譜資訊,建構海洋天然物資料庫與研究資訊交流,加快生物活性天然物的開發,研究成果登上國際期刊《Nature Biotechnology》。

 

天然物在近代生命科學與藥物開發的進展過程中扮演著重要的角色,而微生物的二次代謝物亦是近代抗生素的重要來源;然而,在微生物活性成分的研究中,物種定序鑑種並無法提供足夠的資訊釐清二次代謝物是否曾被研究過。另外,培養條件的變因亦影響二次代謝物的生成,因此往往需要將微生物培養放大,進行耗時耗工的分離純化步驟後,才能了解其活性成分是否為已知。其間過程,耗時耗費,投資報酬率極低。

 

本校海洋生物科技暨資源學系教師廖志中教授長期與美國加州大學生地牙哥分校研究團隊合作,利用少量培養樣品進行質譜實驗,藉由天然化合物的二次質譜特徵資訊,建立生物次級代謝物的分子網絡(molecular network),以分析生物次級代謝物骨架。一方面利用此類資訊建立資料庫比對現有生物次級代謝物,作為去重複(de-replication)研究的策略。另一方面則結合現有活性導引分離法,鎖定具活性組成中特定質譜訊號,於大量培養放大後,針對前述特定分子量之二次代謝物成分作選擇性分離,快速獲得活性成分,以加速活性天然化合物的開發。

 

此研究的創新價值在於應用質譜分子網絡(Mass Spectral Molecular Network) 技術建構了生物二次代謝物的質譜資料庫。此資料庫的建立提供了一個全球天然物科學家研究數據彼此交流的平台。未來在新型具抗生活性之天然化合物的開發研究上,將減少重複研究、降低分離天然物的時間,並減少實驗耗材的消耗,亦提供了快速篩選具有開發潛力特殊骨架化合物一嶄新的研究策略。利用此技術,我們已成功地快速找到特定的海洋弧菌,並自其所產的次級代謝物獲得一系列新穎骨架的天然產物,此類化合物將具有開發為抑制鮑式不動桿菌的抗生素潛力,這些成果亦發表於《Scientific Reports》。

 

(IF 41.514,Biotechnology & Applied Microbiology 2/163)

Scientific Reports (IF 5.228,Multidisciplinary Sciences 7/63)

 

資料來源:http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n8/full/nbt.3597.html ;

                  http://www.nature.com/articles/srep12856

 

發佈日期: 2016-10-11
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