為提升環境永續推動成效，合庫近年積極參與各類保育生態之行動，包括與國立中山大學及農業部水產試驗所澎湖漁業研究中心合作辦理「以碳中和為核心之海洋永續發展計畫」與「海草床復育計畫」，共同推展生態復育、海洋碳匯之重要任務，以具體行動落實環境永續。