牟中原以人工智慧發展的歷史和概念為開場,由解決蛋白質結構預測難題而舉辦的CASP(Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction)競賽,帶出2020年CASP14獲獎的AlphaFold模型,以及2021年CASP15獲獎之RoseTTAFold模型。接著,介紹2024諾貝爾化學獎的三位得主,分別為研發AlphaFold模型的John M. Jumper、Demis Hassabis,以及研發RoseTTAFold模型的David Baker。
牟中原深入淺出地說明John M. Jumper及Demis Hassabis如何運用AlphaFold的人工智慧技術取得目標蛋白的完整胺基酸序列,進而與同源蛋白的比對序列(aligned sequence)組成多重比對序列(multiple sequence alignment, MSA),並以此序列直接預測蛋白質的整體結構,突破過去的知識與技術門檻。同時,他亦分析華盛頓大學David Baker團隊開發的RoseTTAFold模型,講解該模型運作模式,比對分析與AlphaFold模型之間的相似與相異之處,點出人工智慧模型在蛋白質結構預測的革命性發展及未來可能的延伸方向。